Protein–RNA interactions for Protein: P11487

FGF3, Fibroblast growth factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF3P11487 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGF3P11487 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGF3P11487 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGF3P11487 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGF3P11487 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGF3P11487 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGF3P11487 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGF3P11487 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGF3P11487 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGF3P11487 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGF3P11487 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGF3P11487 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGF3P11487 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGF3P11487 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGF3P11487 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGF3P11487 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FGF3P11487 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FGF3P11487 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FGF3P11487 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FGF3P11487 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FGF3P11487 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FGF3P11487 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
FGF3P11487 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGF3P11487 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGF3P11487 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGF3P11487 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGF3P11487 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGF3P11487 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGF3P11487 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGF3P11487 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FGF3P11487 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGF3P11487 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FGF3P11487 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGF3P11487 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGF3P11487 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGF3P11487 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGF3P11487 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGF3P11487 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGF3P11487 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGF3P11487 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGF3P11487 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGF3P11487 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGF3P11487 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGF3P11487 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGF3P11487 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGF3P11487 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGF3P11487 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGF3P11487 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGF3P11487 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGF3P11487 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FGF3P11487 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGF3P11487 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGF3P11487 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGF3P11487 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGF3P11487 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGF3P11487 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGF3P11487 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGF3P11487 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGF3P11487 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGF3P11487 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGF3P11487 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FGF3P11487 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGF3P11487 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGF3P11487 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGF3P11487 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGF3P11487 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGF3P11487 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGF3P11487 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGF3P11487 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGF3P11487 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGF3P11487 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGF3P11487 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGF3P11487 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGF3P11487 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FGF3P11487 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGF3P11487 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FGF3P11487 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGF3P11487 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGF3P11487 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FGF3P11487 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGF3P11487 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGF3P11487 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGF3P11487 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGF3P11487 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FGF3P11487 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGF3P11487 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGF3P11487 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGF3P11487 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGF3P11487 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGF3P11487 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGF3P11487 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGF3P11487 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGF3P11487 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGF3P11487 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGF3P11487 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGF3P11487 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGF3P11487 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGF3P11487 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGF3P11487 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGF3P11487 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms