Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LAMC1P11047 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms