Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARBP10826 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RARBP10826 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARBP10826 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARBP10826 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARBP10826 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RARBP10826 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARBP10826 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARBP10826 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARBP10826 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARBP10826 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARBP10826 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARBP10826 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARBP10826 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARBP10826 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARBP10826 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARBP10826 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARBP10826 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARBP10826 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARBP10826 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARBP10826 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARBP10826 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARBP10826 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARBP10826 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RARBP10826 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RARBP10826 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARBP10826 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RARBP10826 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARBP10826 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARBP10826 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARBP10826 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RARBP10826 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARBP10826 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARBP10826 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARBP10826 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARBP10826 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARBP10826 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARBP10826 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARBP10826 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARBP10826 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARBP10826 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARBP10826 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RARBP10826 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RARBP10826 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RARBP10826 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RARBP10826 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RARBP10826 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RARBP10826 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RARBP10826 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RARBP10826 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RARBP10826 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RARBP10826 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RARBP10826 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RARBP10826 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RARBP10826 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RARBP10826 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARBP10826 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARBP10826 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARBP10826 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARBP10826 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARBP10826 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARBP10826 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARBP10826 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARBP10826 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARBP10826 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARBP10826 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARBP10826 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARBP10826 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARBP10826 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARBP10826 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RARBP10826 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RARBP10826 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RARBP10826 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RARBP10826 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RARBP10826 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RARBP10826 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RARBP10826 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RARBP10826 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RARBP10826 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RARBP10826 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RARBP10826 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RARBP10826 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RARBP10826 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RARBP10826 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARBP10826 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARBP10826 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARBP10826 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARBP10826 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARBP10826 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RARBP10826 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARBP10826 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARBP10826 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARBP10826 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARBP10826 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARBP10826 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARBP10826 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARBP10826 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARBP10826 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARBP10826 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARBP10826 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms