Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRFP10586 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms