Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARAP10276 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARAP10276 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARAP10276 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARAP10276 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARAP10276 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARAP10276 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARAP10276 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARAP10276 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARAP10276 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARAP10276 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RARAP10276 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RARAP10276 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARAP10276 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RARAP10276 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARAP10276 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARAP10276 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARAP10276 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARAP10276 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARAP10276 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARAP10276 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARAP10276 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARAP10276 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARAP10276 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARAP10276 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARAP10276 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARAP10276 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RARAP10276 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RARAP10276 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARAP10276 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARAP10276 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARAP10276 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARAP10276 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARAP10276 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARAP10276 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARAP10276 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARAP10276 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARAP10276 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARAP10276 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARAP10276 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARAP10276 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARAP10276 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARAP10276 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARAP10276 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARAP10276 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARAP10276 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARAP10276 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARAP10276 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARAP10276 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARAP10276 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARAP10276 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARAP10276 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARAP10276 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARAP10276 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARAP10276 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARAP10276 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARAP10276 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RARAP10276 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RARAP10276 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RARAP10276 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RARAP10276 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RARAP10276 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARAP10276 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARAP10276 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARAP10276 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARAP10276 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARAP10276 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARAP10276 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARAP10276 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARAP10276 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARAP10276 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARAP10276 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARAP10276 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARAP10276 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARAP10276 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARAP10276 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARAP10276 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARAP10276 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARAP10276 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARAP10276 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARAP10276 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARAP10276 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARAP10276 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARAP10276 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RARAP10276 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARAP10276 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARAP10276 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARAP10276 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARAP10276 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARAP10276 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARAP10276 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARAP10276 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARAP10276 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARAP10276 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARAP10276 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARAP10276 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARAP10276 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARAP10276 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARAP10276 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARAP10276 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms