Protein–RNA interactions for Protein: P0DP25

CALM3, Calmodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM3P0DP25 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALM3P0DP25 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALM3P0DP25 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CALM3P0DP25 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALM3P0DP25 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALM3P0DP25 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALM3P0DP25 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALM3P0DP25 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALM3P0DP25 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALM3P0DP25 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALM3P0DP25 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALM3P0DP25 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALM3P0DP25 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALM3P0DP25 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALM3P0DP25 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALM3P0DP25 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALM3P0DP25 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALM3P0DP25 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALM3P0DP25 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALM3P0DP25 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALM3P0DP25 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALM3P0DP25 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALM3P0DP25 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CALM3P0DP25 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALM3P0DP25 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALM3P0DP25 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms