Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAM228BP0C875 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms