Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms