Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms