Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3DP05423 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms