Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CYBBP04839 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYBBP04839 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYBBP04839 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYBBP04839 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYBBP04839 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYBBP04839 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYBBP04839 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYBBP04839 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYBBP04839 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYBBP04839 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYBBP04839 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CYBBP04839 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYBBP04839 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CYBBP04839 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CYBBP04839 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYBBP04839 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYBBP04839 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CYBBP04839 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYBBP04839 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYBBP04839 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYBBP04839 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CYBBP04839 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CYBBP04839 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CYBBP04839 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CYBBP04839 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CYBBP04839 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CYBBP04839 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYBBP04839 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYBBP04839 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYBBP04839 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CYBBP04839 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYBBP04839 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYBBP04839 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYBBP04839 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYBBP04839 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CYBBP04839 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYBBP04839 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYBBP04839 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYBBP04839 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYBBP04839 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYBBP04839 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYBBP04839 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYBBP04839 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYBBP04839 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYBBP04839 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYBBP04839 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYBBP04839 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYBBP04839 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYBBP04839 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYBBP04839 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYBBP04839 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYBBP04839 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYBBP04839 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYBBP04839 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYBBP04839 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYBBP04839 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYBBP04839 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYBBP04839 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYBBP04839 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYBBP04839 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYBBP04839 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYBBP04839 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYBBP04839 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYBBP04839 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYBBP04839 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYBBP04839 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYBBP04839 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYBBP04839 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYBBP04839 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYBBP04839 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYBBP04839 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYBBP04839 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYBBP04839 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CYBBP04839 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYBBP04839 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYBBP04839 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYBBP04839 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYBBP04839 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYBBP04839 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYBBP04839 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYBBP04839 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYBBP04839 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYBBP04839 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYBBP04839 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYBBP04839 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYBBP04839 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYBBP04839 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYBBP04839 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYBBP04839 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYBBP04839 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYBBP04839 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYBBP04839 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYBBP04839 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYBBP04839 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYBBP04839 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYBBP04839 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYBBP04839 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYBBP04839 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYBBP04839 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms