Protein–RNA interactions for Protein: P04217

A1BG, Alpha-1B-glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1BGP04217 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
A1BGP04217 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A1BGP04217 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A1BGP04217 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A1BGP04217 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
A1BGP04217 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
A1BGP04217 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
A1BGP04217 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
A1BGP04217 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
A1BGP04217 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
A1BGP04217 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
A1BGP04217 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
A1BGP04217 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
A1BGP04217 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
A1BGP04217 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
A1BGP04217 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
A1BGP04217 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
A1BGP04217 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
A1BGP04217 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
A1BGP04217 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
A1BGP04217 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
A1BGP04217 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
A1BGP04217 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
A1BGP04217 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
A1BGP04217 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
A1BGP04217 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
A1BGP04217 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
A1BGP04217 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
A1BGP04217 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
A1BGP04217 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
A1BGP04217 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
A1BGP04217 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
A1BGP04217 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
A1BGP04217 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
A1BGP04217 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
A1BGP04217 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
A1BGP04217 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
A1BGP04217 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
A1BGP04217 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
A1BGP04217 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
A1BGP04217 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
A1BGP04217 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
A1BGP04217 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
A1BGP04217 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
A1BGP04217 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
A1BGP04217 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
A1BGP04217 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
A1BGP04217 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
A1BGP04217 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
A1BGP04217 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
A1BGP04217 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
A1BGP04217 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
A1BGP04217 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
A1BGP04217 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
A1BGP04217 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
A1BGP04217 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
A1BGP04217 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
A1BGP04217 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
A1BGP04217 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
A1BGP04217 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
A1BGP04217 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
A1BGP04217 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
A1BGP04217 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
A1BGP04217 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
A1BGP04217 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
A1BGP04217 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
A1BGP04217 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
A1BGP04217 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
A1BGP04217 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
A1BGP04217 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
A1BGP04217 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
A1BGP04217 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
A1BGP04217 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A1BGP04217 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A1BGP04217 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A1BGP04217 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A1BGP04217 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
A1BGP04217 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A1BGP04217 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
A1BGP04217 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A1BGP04217 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
A1BGP04217 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A1BGP04217 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
A1BGP04217 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
A1BGP04217 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
A1BGP04217 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
A1BGP04217 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
A1BGP04217 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
A1BGP04217 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
A1BGP04217 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
A1BGP04217 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
A1BGP04217 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
A1BGP04217 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
A1BGP04217 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
A1BGP04217 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
A1BGP04217 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
A1BGP04217 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
A1BGP04217 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
A1BGP04217 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
A1BGP04217 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms