Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOEP02649 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOEP02649 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOEP02649 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOEP02649 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOEP02649 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOEP02649 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOEP02649 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOEP02649 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOEP02649 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOEP02649 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOEP02649 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOEP02649 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOEP02649 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOEP02649 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOEP02649 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOEP02649 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOEP02649 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOEP02649 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APOEP02649 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOEP02649 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOEP02649 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOEP02649 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOEP02649 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOEP02649 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOEP02649 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOEP02649 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOEP02649 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOEP02649 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOEP02649 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOEP02649 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOEP02649 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOEP02649 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOEP02649 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOEP02649 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
APOEP02649 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOEP02649 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOEP02649 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOEP02649 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOEP02649 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOEP02649 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOEP02649 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOEP02649 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOEP02649 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOEP02649 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOEP02649 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOEP02649 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOEP02649 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOEP02649 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOEP02649 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APOEP02649 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOEP02649 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOEP02649 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOEP02649 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOEP02649 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOEP02649 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOEP02649 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOEP02649 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOEP02649 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOEP02649 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOEP02649 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOEP02649 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOEP02649 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOEP02649 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOEP02649 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOEP02649 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOEP02649 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOEP02649 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOEP02649 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOEP02649 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOEP02649 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOEP02649 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOEP02649 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOEP02649 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APOEP02649 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APOEP02649 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APOEP02649 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOEP02649 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOEP02649 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APOEP02649 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APOEP02649 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOEP02649 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOEP02649 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOEP02649 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOEP02649 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOEP02649 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOEP02649 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOEP02649 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOEP02649 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOEP02649 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOEP02649 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOEP02649 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOEP02649 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOEP02649 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOEP02649 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOEP02649 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOEP02649 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOEP02649 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APOEP02649 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APOEP02649 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms