Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EGFRP00533 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EGFRP00533 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EGFRP00533 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EGFRP00533 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EGFRP00533 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EGFRP00533 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EGFRP00533 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EGFRP00533 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EGFRP00533 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EGFRP00533 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EGFRP00533 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EGFRP00533 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EGFRP00533 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EGFRP00533 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
EGFRP00533 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EGFRP00533 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EGFRP00533 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EGFRP00533 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EGFRP00533 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EGFRP00533 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EGFRP00533 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EGFRP00533 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EGFRP00533 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EGFRP00533 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EGFRP00533 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EGFRP00533 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EGFRP00533 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EGFRP00533 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EGFRP00533 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EGFRP00533 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EGFRP00533 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EGFRP00533 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EGFRP00533 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EGFRP00533 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EGFRP00533 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EGFRP00533 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EGFRP00533 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EGFRP00533 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EGFRP00533 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EGFRP00533 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EGFRP00533 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EGFRP00533 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EGFRP00533 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EGFRP00533 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EGFRP00533 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EGFRP00533 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EGFRP00533 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EGFRP00533 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EGFRP00533 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EGFRP00533 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EGFRP00533 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EGFRP00533 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EGFRP00533 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EGFRP00533 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EGFRP00533 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EGFRP00533 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EGFRP00533 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EGFRP00533 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EGFRP00533 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EGFRP00533 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EGFRP00533 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EGFRP00533 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EGFRP00533 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EGFRP00533 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EGFRP00533 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EGFRP00533 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EGFRP00533 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EGFRP00533 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EGFRP00533 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EGFRP00533 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EGFRP00533 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EGFRP00533 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EGFRP00533 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EGFRP00533 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EGFRP00533 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EGFRP00533 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EGFRP00533 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EGFRP00533 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EGFRP00533 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EGFRP00533 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EGFRP00533 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EGFRP00533 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EGFRP00533 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EGFRP00533 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EGFRP00533 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EGFRP00533 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EGFRP00533 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EGFRP00533 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EGFRP00533 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EGFRP00533 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EGFRP00533 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EGFRP00533 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EGFRP00533 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EGFRP00533 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EGFRP00533 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EGFRP00533 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EGFRP00533 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EGFRP00533 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EGFRP00533 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms