Protein–RNA interactions for Protein: O95255

ABCC6, Multidrug resistance-associated protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC6O95255 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC6O95255 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC6O95255 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms