Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KIF4AO95239 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms