Protein–RNA interactions for Protein: O95202

LETM1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1O95202 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LETM1O95202 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LETM1O95202 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LETM1O95202 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LETM1O95202 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LETM1O95202 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LETM1O95202 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LETM1O95202 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LETM1O95202 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LETM1O95202 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LETM1O95202 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LETM1O95202 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LETM1O95202 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LETM1O95202 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
LETM1O95202 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LETM1O95202 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LETM1O95202 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LETM1O95202 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LETM1O95202 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LETM1O95202 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LETM1O95202 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LETM1O95202 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LETM1O95202 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LETM1O95202 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LETM1O95202 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LETM1O95202 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LETM1O95202 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LETM1O95202 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LETM1O95202 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LETM1O95202 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LETM1O95202 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LETM1O95202 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LETM1O95202 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LETM1O95202 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LETM1O95202 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LETM1O95202 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LETM1O95202 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LETM1O95202 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LETM1O95202 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LETM1O95202 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LETM1O95202 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LETM1O95202 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LETM1O95202 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LETM1O95202 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LETM1O95202 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LETM1O95202 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LETM1O95202 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LETM1O95202 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LETM1O95202 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LETM1O95202 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LETM1O95202 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LETM1O95202 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LETM1O95202 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LETM1O95202 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LETM1O95202 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LETM1O95202 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LETM1O95202 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LETM1O95202 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LETM1O95202 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LETM1O95202 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LETM1O95202 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LETM1O95202 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LETM1O95202 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LETM1O95202 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LETM1O95202 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LETM1O95202 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LETM1O95202 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LETM1O95202 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LETM1O95202 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LETM1O95202 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LETM1O95202 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LETM1O95202 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LETM1O95202 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LETM1O95202 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LETM1O95202 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LETM1O95202 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LETM1O95202 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LETM1O95202 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LETM1O95202 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LETM1O95202 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LETM1O95202 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LETM1O95202 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LETM1O95202 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LETM1O95202 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LETM1O95202 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LETM1O95202 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LETM1O95202 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LETM1O95202 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LETM1O95202 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LETM1O95202 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LETM1O95202 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LETM1O95202 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LETM1O95202 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LETM1O95202 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LETM1O95202 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LETM1O95202 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LETM1O95202 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LETM1O95202 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LETM1O95202 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LETM1O95202 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.3 ms