Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG13O75143 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG13O75143 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG13O75143 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG13O75143 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG13O75143 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG13O75143 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG13O75143 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG13O75143 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG13O75143 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG13O75143 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG13O75143 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG13O75143 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG13O75143 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG13O75143 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG13O75143 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG13O75143 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG13O75143 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG13O75143 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG13O75143 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG13O75143 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG13O75143 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG13O75143 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG13O75143 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG13O75143 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG13O75143 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG13O75143 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG13O75143 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG13O75143 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG13O75143 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG13O75143 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG13O75143 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG13O75143 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG13O75143 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG13O75143 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG13O75143 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG13O75143 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG13O75143 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG13O75143 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG13O75143 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG13O75143 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG13O75143 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG13O75143 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG13O75143 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG13O75143 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG13O75143 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG13O75143 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG13O75143 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG13O75143 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG13O75143 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG13O75143 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG13O75143 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG13O75143 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG13O75143 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG13O75143 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG13O75143 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG13O75143 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG13O75143 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG13O75143 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG13O75143 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG13O75143 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG13O75143 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG13O75143 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG13O75143 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG13O75143 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG13O75143 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG13O75143 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG13O75143 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG13O75143 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG13O75143 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG13O75143 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG13O75143 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG13O75143 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG13O75143 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG13O75143 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG13O75143 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG13O75143 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG13O75143 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG13O75143 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG13O75143 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG13O75143 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATG13O75143 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATG13O75143 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATG13O75143 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG13O75143 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG13O75143 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG13O75143 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG13O75143 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG13O75143 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG13O75143 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG13O75143 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG13O75143 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG13O75143 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG13O75143 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG13O75143 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG13O75143 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG13O75143 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG13O75143 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG13O75143 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG13O75143 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms