Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GMDSO60547 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GMDSO60547 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GMDSO60547 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GMDSO60547 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GMDSO60547 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GMDSO60547 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GMDSO60547 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GMDSO60547 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GMDSO60547 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GMDSO60547 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GMDSO60547 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GMDSO60547 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GMDSO60547 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GMDSO60547 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GMDSO60547 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GMDSO60547 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GMDSO60547 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GMDSO60547 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GMDSO60547 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GMDSO60547 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GMDSO60547 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GMDSO60547 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GMDSO60547 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GMDSO60547 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GMDSO60547 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GMDSO60547 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GMDSO60547 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GMDSO60547 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GMDSO60547 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GMDSO60547 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GMDSO60547 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GMDSO60547 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GMDSO60547 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GMDSO60547 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GMDSO60547 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GMDSO60547 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GMDSO60547 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GMDSO60547 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GMDSO60547 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GMDSO60547 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GMDSO60547 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GMDSO60547 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GMDSO60547 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GMDSO60547 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GMDSO60547 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GMDSO60547 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GMDSO60547 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GMDSO60547 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GMDSO60547 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GMDSO60547 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GMDSO60547 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GMDSO60547 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GMDSO60547 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GMDSO60547 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GMDSO60547 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GMDSO60547 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GMDSO60547 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GMDSO60547 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GMDSO60547 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GMDSO60547 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GMDSO60547 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GMDSO60547 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GMDSO60547 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GMDSO60547 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GMDSO60547 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GMDSO60547 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GMDSO60547 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GMDSO60547 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GMDSO60547 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GMDSO60547 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GMDSO60547 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GMDSO60547 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GMDSO60547 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GMDSO60547 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GMDSO60547 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GMDSO60547 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GMDSO60547 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GMDSO60547 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GMDSO60547 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GMDSO60547 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GMDSO60547 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GMDSO60547 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GMDSO60547 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GMDSO60547 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GMDSO60547 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GMDSO60547 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GMDSO60547 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GMDSO60547 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GMDSO60547 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GMDSO60547 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GMDSO60547 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GMDSO60547 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GMDSO60547 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GMDSO60547 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GMDSO60547 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GMDSO60547 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GMDSO60547 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GMDSO60547 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GMDSO60547 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms