Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EDIL3O43854 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EDIL3O43854 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EDIL3O43854 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EDIL3O43854 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EDIL3O43854 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EDIL3O43854 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EDIL3O43854 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EDIL3O43854 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EDIL3O43854 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EDIL3O43854 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDIL3O43854 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDIL3O43854 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDIL3O43854 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDIL3O43854 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDIL3O43854 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDIL3O43854 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDIL3O43854 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDIL3O43854 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDIL3O43854 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EDIL3O43854 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDIL3O43854 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDIL3O43854 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDIL3O43854 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDIL3O43854 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDIL3O43854 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDIL3O43854 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDIL3O43854 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDIL3O43854 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDIL3O43854 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDIL3O43854 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDIL3O43854 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDIL3O43854 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDIL3O43854 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms