Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms