Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms