Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAP3K13O43283 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms