Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYNMO15061 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYNMO15061 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYNMO15061 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SYNMO15061 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SYNMO15061 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SYNMO15061 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SYNMO15061 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SYNMO15061 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SYNMO15061 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SYNMO15061 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SYNMO15061 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SYNMO15061 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SYNMO15061 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SYNMO15061 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SYNMO15061 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SYNMO15061 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SYNMO15061 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SYNMO15061 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SYNMO15061 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SYNMO15061 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SYNMO15061 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SYNMO15061 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
SYNMO15061 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
SYNMO15061 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SYNMO15061 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
SYNMO15061 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
SYNMO15061 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SYNMO15061 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SYNMO15061 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SYNMO15061 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
SYNMO15061 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SYNMO15061 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SYNMO15061 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SYNMO15061 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SYNMO15061 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYNMO15061 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYNMO15061 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYNMO15061 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYNMO15061 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYNMO15061 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYNMO15061 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYNMO15061 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYNMO15061 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYNMO15061 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYNMO15061 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SYNMO15061 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SYNMO15061 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SYNMO15061 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SYNMO15061 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SYNMO15061 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SYNMO15061 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SYNMO15061 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
SYNMO15061 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SYNMO15061 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
SYNMO15061 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SYNMO15061 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SYNMO15061 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SYNMO15061 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
SYNMO15061 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SYNMO15061 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SYNMO15061 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SYNMO15061 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
SYNMO15061 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SYNMO15061 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SYNMO15061 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SYNMO15061 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SYNMO15061 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SYNMO15061 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SYNMO15061 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SYNMO15061 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
SYNMO15061 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SYNMO15061 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SYNMO15061 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
SYNMO15061 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SYNMO15061 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SYNMO15061 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SYNMO15061 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SYNMO15061 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SYNMO15061 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SYNMO15061 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SYNMO15061 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SYNMO15061 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SYNMO15061 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SYNMO15061 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SYNMO15061 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SYNMO15061 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SYNMO15061 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SYNMO15061 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SYNMO15061 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SYNMO15061 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SYNMO15061 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
SYNMO15061 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SYNMO15061 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SYNMO15061 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SYNMO15061 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SYNMO15061 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SYNMO15061 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SYNMO15061 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SYNMO15061 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms