Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SETD1AO15047 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SETD1AO15047 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms