Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC27A2O14975 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A2O14975 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms