Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
EBAG9O00559 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EBAG9O00559 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms