Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARVCFO00192 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms