Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2K7ER74 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms