Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms