Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms