Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KNCNA6PVL3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms