Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms