Protein–RNA interactions for Protein: A6NHQ4

EPOP, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPOPA6NHQ4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPOPA6NHQ4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPOPA6NHQ4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPOPA6NHQ4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPOPA6NHQ4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPOPA6NHQ4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPOPA6NHQ4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPOPA6NHQ4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPOPA6NHQ4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPOPA6NHQ4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPOPA6NHQ4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPOPA6NHQ4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPOPA6NHQ4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPOPA6NHQ4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPOPA6NHQ4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPOPA6NHQ4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPOPA6NHQ4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPOPA6NHQ4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPOPA6NHQ4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPOPA6NHQ4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPOPA6NHQ4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPOPA6NHQ4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPOPA6NHQ4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPOPA6NHQ4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPOPA6NHQ4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EPOPA6NHQ4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPOPA6NHQ4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPOPA6NHQ4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPOPA6NHQ4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPOPA6NHQ4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPOPA6NHQ4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
EPOPA6NHQ4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPOPA6NHQ4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms