Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM247A6NEH6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM247A6NEH6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM247A6NEH6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM247A6NEH6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM247A6NEH6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms