Protein–RNA interactions for Protein: A6NED7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NED7 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
A6NED7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A6NED7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A6NED7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A6NED7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
A6NED7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
A6NED7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A6NED7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A6NED7 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A6NED7 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
A6NED7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A6NED7 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
A6NED7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A6NED7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A6NED7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
A6NED7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A6NED7 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A6NED7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
A6NED7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
A6NED7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A6NED7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
A6NED7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A6NED7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
A6NED7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A6NED7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A6NED7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A6NED7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
A6NED7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
A6NED7 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
A6NED7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
A6NED7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A6NED7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
A6NED7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
A6NED7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
A6NED7 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A6NED7 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A6NED7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A6NED7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A6NED7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A6NED7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A6NED7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
A6NED7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A6NED7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A6NED7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A6NED7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
A6NED7 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A6NED7 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A6NED7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
A6NED7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A6NED7 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A6NED7 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
A6NED7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A6NED7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A6NED7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
A6NED7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A6NED7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A6NED7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A6NED7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
A6NED7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
A6NED7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A6NED7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A6NED7 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A6NED7 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
A6NED7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
A6NED7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A6NED7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A6NED7 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A6NED7 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A6NED7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
A6NED7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A6NED7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
A6NED7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A6NED7 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A6NED7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A6NED7 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A6NED7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A6NED7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A6NED7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A6NED7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A6NED7 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A6NED7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A6NED7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A6NED7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A6NED7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A6NED7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A6NED7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A6NED7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A6NED7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A6NED7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A6NED7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A6NED7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A6NED7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A6NED7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A6NED7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A6NED7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A6NED7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A6NED7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A6NED7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A6NED7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A6NED7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms