Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALM3A6NDB9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms