Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms