Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms