Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAMTA1Q9Y6Y1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms