Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
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