Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms