Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C2

EMILIN1, EMILIN-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN1Q9Y6C2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EMILIN1Q9Y6C2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms