Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX10Q9Y5X0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms