Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U5

TNFRSF18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF18Q9Y5U5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms