Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NRXN3Q9Y4C0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NRXN3Q9Y4C0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NRXN3Q9Y4C0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NRXN3Q9Y4C0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NRXN3Q9Y4C0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NRXN3Q9Y4C0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
NRXN3Q9Y4C0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NRXN3Q9Y4C0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NRXN3Q9Y4C0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NRXN3Q9Y4C0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NRXN3Q9Y4C0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NRXN3Q9Y4C0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NRXN3Q9Y4C0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NRXN3Q9Y4C0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NRXN3Q9Y4C0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NRXN3Q9Y4C0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NRXN3Q9Y4C0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NRXN3Q9Y4C0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NRXN3Q9Y4C0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NRXN3Q9Y4C0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NRXN3Q9Y4C0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NRXN3Q9Y4C0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NRXN3Q9Y4C0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NRXN3Q9Y4C0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NRXN3Q9Y4C0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NRXN3Q9Y4C0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NRXN3Q9Y4C0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NRXN3Q9Y4C0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NRXN3Q9Y4C0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NRXN3Q9Y4C0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NRXN3Q9Y4C0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NRXN3Q9Y4C0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC30■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC30■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NRXN3Q9Y4C0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms