Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KNSTRNQ9Y448 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms