Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE2J1Q9Y385 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE2J1Q9Y385 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2J1Q9Y385 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2J1Q9Y385 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2J1Q9Y385 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2J1Q9Y385 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2J1Q9Y385 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2J1Q9Y385 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2J1Q9Y385 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2J1Q9Y385 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2J1Q9Y385 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2J1Q9Y385 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2J1Q9Y385 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2J1Q9Y385 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2J1Q9Y385 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2J1Q9Y385 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2J1Q9Y385 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2J1Q9Y385 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2J1Q9Y385 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2J1Q9Y385 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2J1Q9Y385 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2J1Q9Y385 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2J1Q9Y385 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2J1Q9Y385 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2J1Q9Y385 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2J1Q9Y385 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms