Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms