Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
THRAP3Q9Y2W1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
THRAP3Q9Y2W1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
THRAP3Q9Y2W1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
THRAP3Q9Y2W1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
THRAP3Q9Y2W1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
THRAP3Q9Y2W1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
THRAP3Q9Y2W1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
THRAP3Q9Y2W1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
THRAP3Q9Y2W1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
THRAP3Q9Y2W1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
THRAP3Q9Y2W1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
THRAP3Q9Y2W1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
THRAP3Q9Y2W1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
THRAP3Q9Y2W1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
THRAP3Q9Y2W1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
THRAP3Q9Y2W1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
THRAP3Q9Y2W1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
THRAP3Q9Y2W1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
THRAP3Q9Y2W1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
THRAP3Q9Y2W1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
THRAP3Q9Y2W1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
THRAP3Q9Y2W1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
THRAP3Q9Y2W1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
THRAP3Q9Y2W1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
THRAP3Q9Y2W1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
THRAP3Q9Y2W1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
THRAP3Q9Y2W1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
THRAP3Q9Y2W1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
THRAP3Q9Y2W1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
THRAP3Q9Y2W1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
THRAP3Q9Y2W1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
THRAP3Q9Y2W1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
THRAP3Q9Y2W1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
THRAP3Q9Y2W1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
THRAP3Q9Y2W1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms